Duplicacions segmentàries a la regió cromosòmica humana 8P23.1evolució i expansió d'una nova família gènica

Resumo

Las duplicaciones segmentarias (DSs), o también llamadas duplicones o Low Copy Repeats (LCRs), son regiones del genoma de un mínio de 1 kb con un alto nivel de identidad (>90%), que estan presentes al menos dos veces en el genoma. La región 8p23.1 consta de 6.5 Mb en la parte distal del cromosoma 8 y está flanqueada por duplicaciones segmentarias. Debido a su arquitectura genómica esta región es susceptible a padecer reordenamientos mediados por recombinación homóloga no alélica entre las DSs, como por ejemplo la inversión polimórfica de 8p23.1, presente en uno de cada cuatro individuos de la población general europea i japonesa, así com otras reorganizaciones menos corrientes. El trabajo realizado en esta tesis doctoral pretende profundizar en la caracterización de la compleja arquitectura genómica de esta región. En nuestra primera aproximación al estudio de las DSs que flanquean la región cromosómica 8p23.1 se identificó una nueva familia génica específica de primates, la familia génica FAM90A. De este modo, gran parte de esta tesis doctoral está centrada en el análisis del origen, formación, evolución y expansión de FAM90A en homínidos. Por otro lado también se ha analizado en detalle la variabilidad de FAM90A como variante en número de copias (CNV) en diferentes poblaciones humanas. Finalmente se ha establecido la frecuencia de la inversión que afecta a 8p23.1 en población española. También se ha procedido a genotipar distintos individuos homozigotos para la inversión y se ha predicho el estatus de la inversión en 150 individuos del proyecto HapMap y se ha analizado el efecto que tiene esta inversión sobre los niveles de expresión de los genes de la región.